داستان فیلم درباره "کلتون" سریعتر از آنچه انتظار داشت رشد کرده ، پدرش او و خواهر کوچکتر و مادرش را رها کرده ، حالا او مسئولیت کارهای روزانه را برعهده گرفته است و ...

در انیمیشن کوبو 2016 ، داستان در زمان چین باستان به اتفاق می افتد، جایی که پسری نوجوان به نام کوبو به همراه مادربزرگش در دهکده ی قدیمی سامورایی ها زندگی می کند. او زندگی آرمی دارد تا اینکه یک شبح شیطانی قدیمی که قصد انتقام گیری از سامورایی ها را دارد به دنبال او آمده و زندگی او را زیر و رو میکند. در همین اوضاع نیز سایر هیولاها به دنبال او آمده اند تا او را بکشند. او باید زرح و شمشیر قدیمی پدرش که قبلا در ارتش سامورایی ها بوده است را پیدا کند و با کمک آن از شر این نیروهای شیطانی رهایی یابد…

لوکاس سایمونز، فیلم‌ساز ۱۱ ساله، پس از دست دادن برادرش دچار وسواس فکری درباره مرگ شده است. وقتی لوکاس به طور تصادفی حضور مرموزی را در یکی از فیلم‌هایش ثبت می‌کند، ناخواسته به یک پدیده در یوتیوب تبدیل می‌شود و حالا باید یاد بگیرد که چگونه در کانون توجه زندگی کند و در عین حال، بار دیگر زندگی خود را به کامل‌ترین شکل ممکن از سر بگیرد.

پسری جوان و خواهر کوچکش متوجه می‌شوند که سگ جدیدشان توسط نامزد پول‌پرست پدرشان دزدیده شده است؛ آن‌ها دوستان خود را برای نجات توله‌سگ محبوبشان به کمک می‌طلبند.